婚姻治疗与个人治疗和一般的团体辅导不同，因为，其面对的对象是一对具有法律保护的夫妻，而这两人的问题也具有一定的独特性和特殊性。因此，在婚姻治疗中要注意以下几个基本原则和方法。
1.治疗师要积极主动  对于本来就带有一定矛盾和冲突的夫妇双方，治疗师要积极主动的参与治疗之中，采取主动的角色来处理问题，避免冷场或场面过于激动。要善于打破僵局，尽快明确治疗的方向。避免个人治疗时，较被动的“倾听”局面。
2.要保持中立，兼顾双方婚姻治疗过程中，需要兼顾双方，让两人都参与治疗中，让每个人都发表一下自己的体会和看法，不能只听一面之词。有时候配偶一方滔滔不绝，很少给对方发表意见的机会，这时，治疗者可以很客气地、有技巧地进行打断，说明要听对方的感受和意见，让没有机会参与的配偶也参与进来。婚姻治疗过程中治疗师不能对任何一方带有倾向性，做到保持中立。特别是在表达治疗师的意见的时候，如果赞同一方的观点时，要小心兼顾另一方的感受，并争取得到另一方的支持。避免被卷入夫妻二人的关系里，演变成三角关系的争执与冲突。特别是那些喜欢用外人的意见来攻击对方的夫妇，治疗师要小心谨慎。
3.婚姻治疗要注意保持中立立场  在婚姻治疗过程中，切忌治疗者被夫妻双方的问题所困扰，甚至卷入夫妻双方之中，有时候会不自觉地偏袒一方，而形成治疗过程中认为的三角关系。由于治疗者性别的缘故，在治疗夫妻问题时，治疗师会自觉与不自觉地同情一方，而对另一方产生情绪反应，这种情况会使治疗不自主地进入一种困境，无法进行下去。特别是有时候，夫妻双方的问题就是因为性别的不同产生争执，或者治疗的一方就是想利用别人来战胜另一方时。如果治疗师能够认识或注意到这些问题，就会十分小心地进行治疗，每一句话不能偏向另一方。如果这种关系处理不好，假如说是位男性的治疗师，如果偏袒丈夫，妻子就会认为是被两个男性联合起来对付自己，如果是偏袒妻子，丈夫就会认为是治疗师有意讨好太太，而引起丈夫吃醋。反过来，女治疗师也同样会发生类似的情况。
4.婚姻治疗的重点是强调双方的协调和适应  婚姻治疗过程中，治疗师的作用是协助夫妻双方相互协调和适应，避免引起双方的争执、相互指责和批评，以免引起双方关系恶化。最忌讳的是不能替夫妻双方做出有关婚姻问题的重大决定，如夫妻是否应该离婚或分居等，更不能用离婚来解决婚姻问题。也不应该指导来访者，是否牺牲婚姻来求得工作上的成就，或放弃事业发展的机会，来照顾维持婚姻等。