森田疗法主要的适应证是所谓“神经质”，大致包括当今分类中的焦虑症、恐怖症、强迫症疑病症、神经症性睡眠障碍等。森田正马认为，发生神经质的人都有疑病素质，诸如神经衰弱、强迫观念、焦虑发作、各种恐怖症（特别是赤颜恐怖）等各类神经症的发病基础是病人的疑病素质。他们对身体和心理方面的不适极为敏感，而过敏的感觉又会促使进一步注意体验某种感觉。所谓疑病素质，是指一种精神上的倾向性，也可称作素质，如果其程度加重，还可以叫做异常人格。疑病素质是人们的一种本性，是生存欲望的显现，它是所有的人都有的一种性情。当其程度过于强烈时，就逐渐开始形成一种异常的精神倾向。同时会出现一些顽固、复杂的神经症症状。疑病素质明显的人，其生存欲望也较为强烈希望自己健康、幸福、蓬勃向上。但是内省力也强于常人，经常为自己的健康状况，生命安全和精神状态而担心，他们把一般人偶尔出现的一些生理现象，如劳累后出现的头晕、心悸等误认为是病而出现紧张、恐惧，随着注意力的越来越固定，感觉也就越来越敏锐。这样一来，感觉和注意就出现一种交互作用。

    症状也就越来越重，形成一个恶性循环。森田认为这种“精神交互作用”是神经质产生的基本机制。并以此来解释强迫观念的产生。正常人都会有和自己理性不符合的观念，只不过往往是一闪而过不留痕迹。有疑病素质的人一旦出现这种观念，便顽固地反复出现，与此同时，出现反复地自我控制，以不让这些念头出现，这样形成拮抗对立，通过精神交互作用，产生强迫观念。森田认为，有疑病素质的人是“完美主义者”，他们总是力图解决那些现实中无法解决的矛盾，对不以人的意志为转移的客观现实采取主观强求的态度，最后使内心冲突加剧，症状也越来越重。有些人只凭自我感觉、观察和判断，把普通人经常有的自我感觉或观念误会成病态的异常现象，并费尽心机要把它排除掉，也可以说强迫观念是对个人苦恼、烦恼发生的恐怖，对患者来说是一种预期性的感受，也可由自我暗示诱发。
    森田把具有疑病素质的人向各类反应引起的各种恶性循环称为神经质，他根据患者症状把神经质症分为3种类型：①普通神经质症；②强迫神经质症；③焦虑神经质症。在神经质的各种病症中，其不同之处在于，神经衰弱患者只不过在意识领域中对其痛苦有所感受；疑病症是对痛苦产生了害怕恐惧，引起对未来的不安，而强迫观念是为了制止恐怖，但却进一步促使了恐怖的发展。