焦虑症的发病原因非常复杂，现代医学迄今还不能完全回答这个问题，但已有的研究发现：

第一，躯体疾病或者生物功能障碍虽然不会是引起焦虑症的惟一原因，但是，在某些罕见的情况下，病人的焦虑症状可以由躯体因素而引发，比如，甲状腺亢进、肾上腺肿瘤。而且，许多研究者试图发现，是不是焦虑症患者的中枢神经系统，特别是某神经递质，是引发焦虑症的罪魁祸首。很多研究集中在两种神经递质上即去甲肾上腺素和血清素。很多研究发现病人处于焦虑状态时，他们大脑内的去甲肾上腺素和血清素急剧变化，但是，我们并不很清楚这些变化是焦虑症状的原因还是结果。

第二，认知过程，或者是思维，在焦虑症状的形成中起着极其重要的作用。研究发现，焦虑症病人比一般人更倾向于将模棱两可的，甚至是良性的事件解释成危机的先兆，更倾向于认为坏事情会落到自己头上，更倾向于认为失败在等待着他们，而低估自己对消极事件的控制能力。

第三，一些研究资料表明，在有应激事件发生的情况下，更有可能出现焦虑症。对焦虑症的起因，不同学派的研究者有不同的意见，虽然这些意见并不一定是相互冲突的。